Curso de Posgrado: Herramientas estadísticas para análisis de variabilidad genética

Docentes: Ing. Agr. (Dra.) Cecilia Bruno. FCA-UNC

Ing. Agr. (Dra.) Andrea Peña Malavera

Lic. (Dra.) Ingrid Teich

.Objetivos:

  • Familiarizar al participante con las técnicas más conocidas de análisis multivariado aplicables a datos provenientes de marcadores molecular
  • Presentar nuevas tecnologías para el análisis de datos provenientes de marcadores moleculares geo-referenciados.
  • Capacitar en el análisis en base al uso de software estadístico Info-Gen y R para análisis de datos genéticos.

Contenidos

Introducción

Motivación con casos de estudio de variabilidad genética molecular y genética del paisaje. Aplicaciones en conservación, manejo y mejoramiento

Análisis multivariado de datos provenientes de marcadores moleculares

Conceptos Generales

Tipos de datos de marcadores moleculares. Codificación y bases de datos. Geo-referencia

Medidas de distancia multivariada

Ordenamiento

Análisis de componentes principales. Biplots

Escalamiento multidimensional métrico

Análisis de Conglomerados

 

Modelación espacial de la variabilidad genética

Concepto y medición de la autocorrelación espacial

Índices de autocorrelación espacial, Test de Mantel y Regresiones

Análisis de Componentes Principales Espacial (sPCA)

Aplicaciones de geoestadística (semivariogramas y correlogramas discretos).

Correlación de variabilidad genética con datos fenotípicos

Metodología del curso:

Modalidad teórico-práctico. Clases teórico prácticas distribuidas en dos (2) encuentros de dos días cada uno. Clases prácticas y discusión de estrategias de análisis para el trabajo final integrador a través de aula virtual

Evaluación:

Para realizar la evaluación final deberá haber asistido al 80% de las actividades. Se aprobará con 7 (siete) o más puntos en escala de 1 (uno) a 10 (diez). El trabajo integrador final consta de la resolución de situaciones problemas y podrá ser abordado Individualmente o en grupo de hasta tres integrantes.

Duración del curso:

40 horas.

 

Créditos:

2 créditos

Arancel:De acuerdo a lo dispuesto por el HCD para el año académico 2017

Fecha de realización:

25 al 29 de Septiembre de 2017 en el horario de 9:00 a 16:30 hs

 

Destinatarios:

Dirigido a profesionales con título expedido por Universidad Pública o Privada o Extranjera afín a las Ciencias Agropecuarias, Forestales, Biológicas o Ambientales. Acreditar ejercicio profesional, formar parte de equipos de investigación o ser becario de Ciencia y Tecnología con ejercicio de tareas de investigación científica y tecnológica.

Requerimientos

Cada asistente al curso deberá traer una notebook con el software Info-Gen, R y la conexión entre ambos.

Bibliografía:

Balzarini M, Bruno C, Peña A, Teich I y Di Rienzo J. (2010). Estadística en Biotecnología. Aplicaciones en Info-Gen. Editorial Brujas. Pp 227.ISBN 9871432682.

Bruno C y Balzarini M (2013). Estadística Multivariada. Aplicaciones en Info-Gen y R.

Bruno C, Teich I, Peña A y Balzarini M. (2011) “Análisis de Variabilidad Espacial de datos genéticos usando InfoGen y R”. Material didáctico para la mesa de análisis in situ de la XVI Reunión Científica del Grupo Argentino de Biometría. Salta, octubre de 2011.

Software:

Se utilizará el software estadístico Info-Gen (Balzarini y Di Rienzo et al., 2004) y su conexión con el software R (R Core Team, 2015).

 

Balzarini M.G., Di Rienzo J.A. InfoGen versión 2004. FCA, Universidad Nacional de Córdoba, Argentina. URL http://www.info-gen.com.ar.

R Core Team, 2015. R: A language and environment for statistical computing. R Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria. URL http://www.R-project.org/.